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首都儿科研究所前身是中国医学科学院儿科研究所，成立于1958年，是新中国第一家以研究儿童保健儿科疾病为重点，兼有医疗教学和预防任务的应用医学研究机构研究所先后10次获得北京市属科研院所“改革与发展”一等奖，18次获得首都及卫生系统“文明单位”的称号。