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首都儿科研究所属于公立非营利性医疗机构，是集儿科基础研究临床高等教育预防保健为一体的儿科医学机构是北京协和医学院联合申报儿科学博士硕士学位授权点国务院学位办批准的临床医学一级学科硕士学位授权点北京大学。

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